Корневой Сельдерей убирают до заморозков, обычно в середине октября. Выкапывают в сухую погоду, обрезают листья (оставляя пенёк 2–3 см) и корни. Хранят в погребе при 0–2°C и влажности 90% в ящиках с песком или в холодильнике. Подмороженные корнеплоды долго не лежат — их лучше сразу переработать.